O LabTelemed foi criado em dezembro de 2000 através de um Projeto FUNGRAD e em cooperação com diversos professores e pesquisadores da área médica como consequência do início da aplicação prática das atividades de P&D realizadas pelo Projeto Cyclops/LISHA no desenvolvimento de tecnologias de sistemas de arquivamento e transmissão de imagens médicas (PACS) e de tecnologias na área de processamento e interpretação de sinais e imagens médicas.

Atualmente o LabTelemed é administrado pela equipe do Instituto Nacional de Convergência Digital (INCoD).